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包

品

目

号

名称

服务内容及要求

数量

竞价单价

竞价总价

完成时间

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16个心启杓兰重测序和36个心启杓兰转录组测序分析服务

一、技术指标：

1.重测序建库测序

构建16个350bp二代DNA文库；采用MGI2000平台进行测序；测序深度15X，即每个样本的数据量为450G clean data, 即下机的总测序数据量为7200G clean data；

2、重测序分析

（1）测序评估（碱基含量分布、测序评估、质量分布及统计 ）；

（2）比对统计（比对统计比对率、基因组覆盖度、测序深度等）；

（3）SNP检测、注释及统计

（4）InDel检测、注释及统计

（5）SV 检测、注释及统计

（6）CNV检测、注释及统计

3、转录组建库测序

完成36个植物转录组的样本提取，获得高质量的RNA。构建36个二代RNA文库库检合格后，利用MGISEQ-2000平台，对文库上机测序。测序深度为每个样本的数据量为20Gclean data, 即下机的总测序数据量为720G clean data；对下机数据进行过滤和质控。

转录组分析：

（1）参考基因组比对

（2）新转录本预测

（3）SNP和INDEL检测

（4）差异剪接基因检测

（5）基因表达量计算（基因比对率及表达数目统计、Reads对转录本的覆盖度及分布、样品间的相关性、PCA分析、样品中基因表达量的分布、样品间及组间的基因表达情况）

（6）基因表达量聚类分析

（7）时间序列分析

（8）差异表达基因检测

（9）差异表达基因维恩图分析

（10）差异表达基因层次聚类分析

（11）差异表达基因GO功能分析

（12）差异表达基因Pathway功能分析

（13）差异表达基因TF编码能力预测

（14）差异表达基因蛋白互作分析

（15）差异表达基因中的植物抗病基因预测

二、售后服务：

1、投诉和建议响应时间要求：

48h内响应投诉或建议，72h内反馈改进方案。

2、数据保存及传输要求：

数据保存12个月，中标人需提供移动硬盘用于数据传输。在项目完成后1年之内，如果项目结果存在疑义或者不完善的（例如数据分析存在差错、数据量不够），项目委托方对中标公司保留追究责任的权利，并与中标人协商解决。

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287000

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合同签订后的30日内完成 

合计：人民币（大写）贰拾捌万柒仟元整（￥287000.00）

成交供应商：深圳华大基因科技服务有限公司  卢恒宇18050333502